يعتبرهذا البرنامج من أهم البرامج لدى المؤسسة ويستهدف قطاع المنظمات الغير حكومية وقطاع التقابات العمالية ويهدف البرنامج إلى بناء قدرات منظمات المجتمع المدنى لتؤدى وظائفها بشكل أكثر فاعلية وتعمل فى برامج تؤدى لنتائج ملموسة  وذلك لإيمان مؤسسة أبناء المحروسة  بأن المجتمع المدنى هوعصب التنمية فى المجتمع فى كل المجالات التنموية، وتؤمن المؤسسة بأنه كلما زادت مهارات وقدرات المجتمع كلما زادت مشاركته فى خدمة أعباء التنمية وسد الفجوات التنموية مع مؤسسات الدولة حيث تعد هذة المنظمات الضلع الثالث من أضلع التنمية فى مصر.

نعمل من خلال ثلاثة أهداف أساسية:

• الدفاع عن حرية التنظيم والحق فى التنظيم.
• بناء القدرات للمؤسسات والنقابات المنشأة حديثاً والتطوير المؤسسى لتحديث وتزويد المؤسسات بالمستجدات فى المناهج التنموية المختلفة.
• إدارة المشروعات من خلال تبنى مشاريع تنموية